Mohli bychom se zbavit komárů, aniž bychom znečišťovali životní prostředí? Ano, můžeme, říkají výzkumníci. Toxin BinAB, produkovaný v krystalické formě bakterií, specificky zabíjí larvy komárů Culex a Anopheles, ale je neaktivní u komárů tygrovaných (nebo Aedes), přenašečů horečky dengue a chikungunya. Znalost molekulární struktury BinAB je nezbytná, pokud chceme rozšířit spektrum jeho působení. Vzhledem k tomu, že tato struktura byla dlouho nepřístupná, je nyní 28. září 2016 publikována v Nature mezinárodním konsorciem zahrnujícím vědce z Institut de Biologie Structurale (CNRS/CEA/Université Grenoble Alpes) ve Francii a UCLA, UCR a SLAC v USA..
Komáři jsou přenašeči mnoha ničivých nemocí, včetně malárie, kterou šíří komáři rodu Anopheles, a filariózy přenášené komáry rodu Culex. Toxin BinAB, produkovaný ve formě nanokrystalů bakterií Bacillus sphaericus, se specificky zaměřuje na larvy těchto dvou skupin komárů. Složitý proces intoxikace v pěti krocích (viz příloha níže) vysvětluje ekologickou bezpečnost BinAB, který je neškodný pro ostatní hmyz, korýše a lidi. BinAB se proto v mnoha zemích používá k regulaci populace komárů.
Síla BinAB je bohužel zároveň jeho slabinou: toxin je neúčinný na larvy komárů rodu Aedes, kteří šíří viry horečky dengue, Zika a chikungunya. Remodelace BinAB by mohla umožnit rozšíření jeho spektra, ale k dosažení tohoto cíle je nutné porozumět jeho struktuře. Rentgenová krystalografie je vynikající metodou k odhalení struktury proteinu, ale obecně je použitelná pouze pro velké krystaly o rozměrech kolem desetiny milimetru. Přesto nanokrystaly BinAB, které se vyvíjejí in vivo, měří pouze desetitisíciny milimetru a jakmile se rozpustí, toxin nerekrystalizuje.
Mezinárodní konsorcium vědců vedené Jacquesem-Philippe Colletierem, vědcem CNRS z Institut de Biologie Structurale (CNRS/CEA/Université Grenoble Alpes), Brianem Federicim, profesorem na University of California, Riverside (UCR) a David Eisenberg, profesor na University of California, Los Angeles (UCLA), právě publikoval tuto strukturu, vyřešenou prací na přírodních nanokrystalech.
Tváří v tvář překážce malé velikosti těchto krystalů použili nový typ zdroje rentgenového záření, laser s volnými elektrony, který poskytuje ultrakrátké, ale vysoce intenzivní pulsy rentgenového záření. Protože nebylo nic známo o struktuře BinAB, byl vyžadován čistě experimentální přístup pro stanovení struktury (de novo fázování), který byl dříve aplikován pouze na vzorky známých struktur, aby se prokázala jeho proveditelnost.
Struktura BinAB je tedy nejen první, která byla vyřešena z tak malých krystalů (~ 300 nm), ale také první neznámou strukturou, která byla odhalena de novo pomocí laseru s volnými elektrony. To vyvolává naděje na vyřešení struktur z menších a složitějších přírodních shromáždění, jako jsou organely, složky buněk.
Pochopení struktury BinAB okamžitě otevírá cestu k rozšíření jeho spektra účinku s cílem vyvinout toxin „tři v jednom“, který se může zaměřit na larvy tří typů komárů: Aedes (aby bylo možné zejména kontrolovat šíření viru Zika, Culex (vektor pro filariózu) a Anopheles (vektor pro malárii).